CICCOLELLA, SIMONE

CICCOLELLA, SIMONE  

DIPARTIMENTO DI INFORMATICA, SISTEMISTICA E COMUNICAZIONE  

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Titolo Tipologia Data di pubblicazione Autori File
RecGraph: recombination-aware alignment of sequences to variation graphs 01 - Articolo su rivista 2024 Avila Cartes J.Bonizzoni P.Ciccolella S.Della Vedova G.Denti L.Monti D. C.Pirola Y. +
Accurate and fast clade assignment via deep learning and frequency chaos game representation 01 - Articolo su rivista 2023 Avila Cartes J.Ciccolella S.Bonizzoni P.Della Vedova G. +
Reads2Vec: Efficient Embedding of Raw High-Throughput Sequencing Reads Data 01 - Articolo su rivista 2023 Ciccolella S.Della Vedova G.Patterson M. +
Three Metaheuristic Approaches for Tumor Phylogeny Inference: An Experimental Comparison 01 - Articolo su rivista 2023 Ciccolella, SDella Vedova, G +
Clustering SARS-CoV-2 Variants from Raw High-Throughput Sequencing Reads Data 02 - Intervento a convegno 2022 Ciccolella, SDella Vedova, G +
Practical algorithms for Computational Phylogenetics 07 - Tesi di dottorato Bicocca post 2009 2022 CICCOLELLA, SIMONE
Effective Clustering for Single Cell Sequencing Cancer Data 01 - Articolo su rivista 2021 Ciccolella S.Patterson M.Bonizzoni P.Della Vedova G.
Inferring Cancer Progression from Single-Cell Sequencing while Allowing Mutation Losses 01 - Articolo su rivista 2021 Ciccolella, SimoneSoto Gomez, MauricioPatterson, MurrayBonizzoni, PaolaDella Vedova, Gianluca +
MALVIRUS: an integrated application for viral variant analysis 01 - Articolo su rivista 2021 Ciccolella S.Denti L.Bonizzoni P.Della Vedova G.Pirola Y.Previtali M.
Simpler and Faster Development of Tumor Phylogeny Pipelines 01 - Articolo su rivista 2021 Ciccolella S.Lucarella L.Della Vedova Gianluca. +
Triplet-based similarity score for fully multi-labeled trees with poly-occurring labels 01 - Articolo su rivista 2021 Ciccolella, SimoneBernardini, GiuliaDenti, LucaBonizzoni, PaolaPrevitali, MarcoVedova, Gianluca Della
gpps: an ILP-based approach for inferring cancer progression with mutation losses from single cell data 01 - Articolo su rivista 2020 Ciccolella S.Soto Gomez M.Patterson M. D.Della Vedova G.Bonizzoni P. +
Does Relaxing the Infinite Sites Assumption Give Better Tumor Phylogenies? An ILP-Based Comparative Approach 01 - Articolo su rivista 2019 Bonizzoni, PaolaCiccolella, SimoneDella Vedova, GianlucaSoto Gomez, Mauricio
Effective clustering for single cell sequencing cancer data 02 - Intervento a convegno 2019 Ciccolella, SPatterson, MDBonizzoni, PDella Vedova, G
PhISCS: a combinatorial approach for subperfect tumor phylogeny reconstruction via integrative use of single-cell and bulk sequencing data 01 - Articolo su rivista 2019 Ciccolella, Simone +
GPPS: an ILP-based approach for inferring cancer progression with mutation losses from single cell data 02 - Intervento a convegno 2018 Ciccolella, SimoneGomez, Mauricio SotoPatterson, MurrayVedova, Gianluca DellaBonizzoni, Paola +
Beyond Perfect phylogeny: Multisample Phylogeny reconstruction via ILP 02 - Intervento a convegno 2017 Bonizzoni, PDella Vedova, GCiccolella, SSOTO GOMEZ, MAURICIO ABEL